マンガンは（マグネシウムと共に）脂質・糖質・タンパク質の代謝に関与し、脳や神経、筋肉が健康に働く 上でかかせません。マグネシウムが関与するさまざまな酵素の反応にマンガンも関与していて、カルシウム・リンとともに骨の生成、 石灰化を促す重要なミネラルです。
　マンガンが不足すると運動障害、動脈硬化、血中脂肪酸の増加、骨や軟骨の発育不良、 生殖機能低下、骨粗鬆症、てんかん発作などがあらわれることがありますが、通常の食生活では欠乏することはほとんど無いでしょう。 過剰に摂取した場合は神経痛、パーキンソン病、不安感、脱力感、記憶・判断力障害などの症状が心配されます。